Het zou kunnen dat sommige mensen allergisch reageren op alpacawol, maar die kans is wel veel kleiner dan bij andere soorten wol. Normaal gesproken is het stofje lanoline in alpacawol volledig afwezig, maar het zou kunnen dat er toch een heel kleine hoeveelheid van aanwezig is. Toch wordt alpacawol aangemerkt als hypoallergeen. Dat heeft ook te maken met het feit dat de huisstofmijt zich er veel minder snel in zal nestelen. Alpacawol werkt namelijk vochtregulerend, waardoor het niet de ideale, vochtige omgeving vormt waar het beestje zo van houdt.